Dewan Pembina:
- Ketua MPR RI (Dr. M. Hidayat Nur Wahid, MA)
- Menteri Pendidikan Nasional
- Menteri Agama RI
- Dirjen Dikti Diknas
- Dirjen Pendidikan Islam Depag
Dewan Penasehat:
- Prof. Dr. KH. Didin Hafiduddin, M.Sc. (IPB)
- Prof. Dr. KH. Miftah Faridh (ITB)
- Drs. Hamdan Mansyur, MM (Dikti Diknas)
Dewan Pakar:
- Prof. Dr. Azyumardi Azra (UIN Jakarta)
- Prof. Abdurrahman Mas`ud, M.A., PhD (Depag RI)
- Prof. Dr.Idrus Affandi, SH (UPI Bandung)
- Prof. Arif Furqon, P.h.D (Depag RI)
Ketua Umum:
- Dr. Syahidin, M.Pd. (UPI)
Sekretaris Jendral:
- Drs. Munawar Rahmat, M.Pd. (UPI)
Bendahara Umum:
- Dr. Fuadi Anwar, M.A. (UNP)
Bidang Standarisasi perkuliahan, dosen PAI:
- Ketua: Prof.Dr.Dahlia M.Su’aib.MA (UNTAD)
- Sekretaris : Dr.Nurwahidin, M.Ag. (UI)
Bidang Fatwa dan Pengkajian Islam:
- Ketua: Prof. Dr. H. Tohir Luth (UNIBRAW)
- Sekretaris: Dr. Ramlan Rangkuti.MA (USU)
Bidang Advokasi, Hukum dan HAM:
- Ketua: Prof. Dr.Zainudin Ali, MA. (UNTAD)
- Sekretaris: Rohidin, S.H., M.Ag. (UII Yogya)
Bidang Humas dan Kerjasama Kelembagaan:
- Ketua: Dr. Amirsyah Tambunan, M.Ag (USU)
- Sekretaris: Fahmi Lukman, M.Si. (UNPAD)
Bidang Penelitian dan Pengembangan:
- Ketua: Prof. Dr. H. Basir Syam, M.A. (UNHAS)
- Sekretaris: Drs. Abdul Khalik Wijaya, M.Si. (ITENAS)
Bidang Diklat & Pengabdian pada masyarakat:
- Ketua: Dr. Cecep Alba, M.A. (ITB)
- Sekretaris: Dra. Zulmaizarna, M.Pd.I. (Universitas Yarsi)
DEWAN PIMPINAN WILAYAH
1. Provinsi Jawa Barat
- Ketua: Prof. DR. H. Mahmud Syafei, M.Ag, M.Pd.I
- Sekretaris Umum : Drs.H. A. Syamsu Rijal, M.Pd
2. Provinsi Sulawesi Selatan
- Ketua: Drs. H. Munawir Kamaludin, M.Ag
- Sekretaris: A. Marjuni, S.Ag, M.Pd.
3. Provinsi Sumatra Utara
- Ketua: Drs. Supardi, M.Ag
- Sekretaris: Drs. H. Ramli Noor, M.Ag
4. Provinsi Sumatra Barat
- Ketua: Drs. H. Idzharman, M.Ag
- Sekretaris: Drs. Ahmad Kosasih, M.Ag
5. Provinsi Bengkulu
- Ketua: Salahuddin Yahya, S.Ag, M.Si.
- Sekretaris: Amrullah Boerman, S.Ag, M.Si
6. Provinsi Sulawesi Tenggara
- Ketua: Dra.Ana Faturinggi.M.Ag
- Sekretaris: Yusdin Gagaramusu, Lc, M.Ed.
7. Provinsi Kalimantan Tengah
- Ketua: Drs. H. Ahmad Aini Baderi, S.H, M.H.
- Sekretaris: Drs. H.Rohis Mahpud
8. Provinsi Kalimantan Barat
- Ketua: Drs. H. Mahfud Sidik., MA
- Sekretaris: Nuryadin, M.Ag
9. Provinsi DKI Jakarta
- Ketua: Dr. Amirsyah Tamunan, M.Ag.
- Sekretaris: Muhammad Aziz.M.Ag
10. Provinsi Jawa Tengah
- Ketua: Drs. M.Taufik, MA
- Sekretaris: Farhan, M.Ag
11. Provinsi Jawa Timur
- Ketua: Prof. Dr.Kaswi Saiban. M.Ag
- Sekretaris: Drs. HM. Dahlan.M.Pd
12. Provinsi Maluku
- Ketua: Drs.Yunus Rahawarin.M.Ag
- Sekretaris: Drs.Nur Said. M.Ag.
13. Provinsi Kalimantan Barat
- Ketua: Drs. H. Supriadi, M.Ag
- Sekretaris: Dr. H. Pabali Yusuf, M.Ag.
14. Provinsi Kalimantan Barat
- Ketua: Drs. H. Supriadi, M.Ag
- Sekteraris: Dr. Pabli Musa, M.Ag
15. Provinsi Riau
- Ketua: Drs. Hamzah, M.Ag
- Sekretaris: Nurhasanah, M.Ag
16. Provinsi Sulawesi Utara
- Ketua: Dr. Jailani, M.Sc
- Sekretaris: Drs. Gaida Bahmid, M.Si
17. Provinisi Aceh Daussalam
- Ketua: Drs, Amsal Amri, M.Pd
- Sretaris: Siamu Manurung, M.Ag
18. Provinsi Jambi
- Ketua: Drs. Ishak Muhammad, M.Ag
- Sekretaris: Supian, M.Ag
19. Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta
- Ketua: Dr. Ajat Sudrajat, M.Ag
- Sekretaris: Drs. Malik Abdullah, M.Ag
20. Provinsi Nusa Tenggara Barat
- Ketua: Dr. M.Taufiq, M.A
- Sekretaris: Drs.H.Badrun.M.Pd